הפגיעה בבעלי-חיים בצה"ל נעשית ברמות שונות. המערך הלוחם פוגע בבעלי-חיים לרוב כתוצאה מטעות או מחוסר אחריות (למעט שימוש בחיות לצורכי מלחמה), בעוד המערך תומך-הלחימה פוגע בבעלי-חיים בצורה מכוונת.
המערך הלוחם
מקרים של פגיעה בבעלי-חיים בקרב המערך הלוחם פורסמו בשנים האחרונות; בעיתון "במחנה" נכתב על חיילים אשר משתמשים בבעלי-חיים כ"מטרות" לירי, בניגוד להוראות. מקרה מפורסם נוסף הוא של נשרים ברמת הגולן שמתו כתוצאה מאכילת פגרים של בעלי חיים אשר הורעלו מתחמושת צבאית.
לצבא יחידת-כלבים לוחמת ("עוקץ") אשר משמשת את המערך הלוחם לגילוי תחמושת ולאזהרה. בזמן הכיבוש הישראלי בדרום לבנון כלבים רבים מיחידת "העוקץ" נהרגו, כמו גם במלחמה הנוכחית בשטחים (נכון לתאריך 13.3.2005, נהרגו 21 כלבים בשטחים מאז תחילת האינתיפאדה). ארגוני זכויות בעלי-חיים בכל העולם מגנים צבאות אשר משתמשים בחיות לצורכי לחימה.
כתוצאה ממיקוש, נהרגים כל שנה בעלי חיים רבים.
קטעי מידע:
מורעלי צבא. למה נכחדו הנשרים הישראלים בטבע? (קובץ תמונה).
חיות משמשות כמטרה לאימונים. סוכנות הידיעות correspondents in Jerusalem, ידיעה מתאריך 14.6.04 (קובץ DOC). דיווח (באנגלית) על כתבה מבמחנה, שעוסקת בשימוש בחיות לצורכי אימונים.
20 פרות מתו לאחר שעלו על מוקשים בגולן. אלי אשכנזי, ואללה חדשות, 17.3.05 (קובץ אינטרנט).
המערך תומך-הלחימה
בקרב המערך תומך-הלחימה הפגיעה הידועה ביותר בבעלי-חיים היא ניסויים בבעלי-חיים, או בחיל הרפואה או באחת מיחידות השדה.
מידע על ניסויים בבעלי-חיים בצה"ל חשאי ואינו דולף החוצה. על הניסויים במערכת הביטחון מפקח וטרינר ממונה על-ידי מבקר מערכת הביטחון, אשר אינו חייב דיווח לגורמים חיצוניים. המקרים המפורסמים היחידים הם מקרים שבהם חיילים הודיעו על הניסויים.
פיצוץ חזירים. בתחילת שנות ה- 90 בוצע ניסוי שמהלכו פוצצו עשרות חזירים. מטרת הניסוי לבדוק מה קורה ליצורים חיים כתוצאה מפיצוץ. חייל שהשתתף בניסוי מעיד: "מה שקרה אחר כך חוזר אלי בסיוטים. למרות שהיינו במרחק גדול ממקום הפיצוץ יכולנו מיד לשמוע צרחות מזוויעות מתוך הקרוואן. כשפתחנו את הדלת שלו היה קשה להביט פנימה. החזירים שכבו שם ובכו וצרחו. היה ברור שההדף פוצץ אותם מבפנים והזכוכיות שהותזו מהחלונות שהתנפצו, חתכו אותם מבחוץ. כל הקירות היו מלאים דם, שתן וצואה של החזירים הכפותים". בשנת 2004 דווח שוב על ניסוי זהה.
ATLS במהלך קורס טראומה הנערך בבית הספר לרפואה בצריפין (בה"ד 10), מחויבים רופאים צבאיים לתרגל הכנסת נקז ריאה התרגול מבוצע על כלבים חיים, בהרדמה. הניסוי, ATLS - Advanced Trauma Life Support, עורר סערה ציבורית רבה בעקבות רופאים שהודיעו שהם מסרבים לבצע את הניסוי, ופנו לעיתונות. יש לציין כי הקורס הצה"לי הוא הקורס היחידי בארץ לשיטת ההחיאה הזאת, והתעודה מתקבלת בכל העולם. בשנת 2002 היה אמור להתבצע ניסוי ATLS, שבמהלכו היו אמורים להמית 200 כלבים. בעקבות הפירסום נוצר לחץ ציבורי נרחב נגד הניסוי -- והוא בוטל.
קטעי מידע:
קורבנות המלחמה הבאה מתים עכשיו -- ניסויים צבאיים בבעלי-חיים. שבועון "זכויות בעלי-חיים השבוע", מתוך אתר האינטרנט: אנונימוס (קובץ אינטרנט).
מתים להשתתף בניסוי. וואלה, מתוך אתר האינטרנט: האגודה הישראלית נגד ניסויים בבעלי-חיים, 16.12.02 (קובץ אינטרנט).
הם מפוצצים גם חזירים. ראובן וייס, ידיעות אחרונות, 3.11.04 (קובץ תמונה).
200 כלבים מתים. בפקודה. רן הר נבו, עיתון תל אביב. מתוך אתר האינטרנט: האגודה הישראלית נגד ניסויים בבעלי-חיים, 14.2.03 (קובץ אינטרנט).
להפסיק שימוש בכלבים בתרגולי החייאה בצה"ל. תמר נהרי, וואלה. מתוך אתר האינטרנט: האגודה הישראלית נגד ניסויים בבעלי-חיים, 7.11.02 (קובץ אינטרנט).
איך מרגיש כלב בריא כשפותחים לו את הבטן? וואלה, מתוך אתר האינטרנט: האגודה הישראלית נגד ניסויים בבעלי-חיים, 9.3.03 (קובץ אינטרנט).
היום בבה"ד 10: ניסוי בעשרה כלבים. וואלה, מתוך אתר האינטרנט: האגודה הישראלית נגד ניסויים בבעלי-חיים, 28.1.02 (קובץ אינטרנט).
בעקבות הפרסום בוואלה!: ניסוי הכלבים בבה"ד 10 בוטל. וואלה, מתוך אתר האינטרנט: האגודה הישראלית נגד ניסויים בבעלי-חיים, 29.1.02 (קובץ אינטרנט).